吳哥航空無預警停飛，除了造成許多旅客的恐慌，權益受損，許多旅行社也是叫苦連天，像是和吳哥航空有包機合約關係的東南、品冠、雄獅等旅行社，損失估計將近千萬，而這條航線停飛之後，因為不能從台灣直飛吳哥窟，旅客要去吳哥窟觀光，來回的交通時間最多得多花七個小時。
一大早旅行社員工接電話手沒停過，即使是週末，員工們還是得上班，緊急處理吳哥航空停飛之後旅客的權益問題。
部分旅行業者願意全額退費，讓消費者暫時了鬆一口氣，但國內八間和吳哥航空有包機業務往來的旅行社，包括已經切票的機票費、預付的住宿費、交通費，一家旅行社損失將近千萬，規模較小的旅行社，可能承受不了這樣的損失。
除了旅行社大地震，未來想要到吳哥窟旅遊的旅客也將受到不少影響，因為從台灣直飛吳哥窟以往只要3.5個小時，這條航線暫時停飛之後，旅客只能選擇坐中華或長榮先到金邊再轉機，或拉6小時的車才能到目的地，或者是搭乘越南航空在胡志明市轉機，來回就多了整整4個小時。
雖然目前傳出華信航空對於這條航線有相當大的興趣，但何時才能取得航權？台灣旅客像以往一樣想快速便捷的到吳哥旅遊，恐怕還要一段時間。
引用~今日新聞報導 2008/05/10